现如今，有多种动物实验模型被广泛用于研究炎症性肠炎（inflammatory bowel disease, IBD）的病因、发病机制及测试新开发药物药效等，尤其以葡聚糖硫酸钠盐（Dextran Sulfate Sodium Salt,DSS）结肠炎（ulcerative colitis,UC）模型应用最广。
脓毒症（Sepsis）是指由感染因素引起的全身炎症反应综合征。严重者可导致器官功能障碍和（或）循环障碍，是严重创伤、烧伤、休克、感染和外科大手术等常见的并发症。按脓毒症严重程度可分脓毒症、严重脓毒症和脓毒性休克，进一步发展可导致多器官功能障碍综合征等。
非酒精性脂肪肝（non-alcoholic fatty liver disease，NAFLD）包含了一系列的疾病发展阶段，从一般脂肪变性进展到脂肪变性与炎症并发的非酒精性脂肪肝炎（NASH），随后进展为肝纤维化、肝硬化和肝癌。大多数肥胖的成年人有脂肪肝型态，他们的患病率达到 30% 以上，因此，NAFLD 的患病率会随着肥胖率的升高而升高。
饮食诱导的肥胖（DIO，diet-induced obsisity），是当前研究的热点。目前常用的肥胖动物模型主要分为四大类：食物诱导型、下丘脑损伤型、内分泌失调型和遗传型。
肝炎-肝硬化-肝癌（Hepatitis-Cirrhosis-Hepatocellular Carcinoma, HCC）是慢性肝病进展的典型“三部曲”。动物模型是研究该病理过程及分子机制的重要工具。
胆结石（Gallstone, GS）是胆汁成分异常沉积形成的结晶性疾病，主要分为胆固醇结石和色素性结石两大类。建立稳定可靠的胆结石动物模型是研究其发病机制、药物干预及预防策略的关键。大小鼠因其遗传背景清晰、繁殖周期短、成本低等优势，成为GS研究的理想模型。
急性肝损伤（Acute liver injury，ALI）是急性肝衰竭的基础，严重或持续的肝损伤，最终导致急性重症肝炎或爆发性肝炎而死亡。
胃溃疡（gastric ulcer , GU）是人类消化系统最常见的疾病之一，在世界范围内发病率和患病率都在持续增加。胃溃疡主要发生在胃窦的胃小弯和鼻窦，通常是胃酸或胃蛋白酶在胃肠道黏膜中自行消化引起的。
