肠道类器官是一种来源于干细胞的三维体外培养系统，能够在体外模拟肠道的组织结构与功能。它是利用干细胞（包括成体干细胞和多能干细胞）在含有生长因子的三维基质（如Matrigel）中诱导形成，具有与体内肠道上皮相似的细胞组成和组织结构。
胰腺癌是消化道常见恶性肿瘤之一，在肿瘤领域有“癌症之王”的称号。据柳叶刀杂志记载，胰腺癌确诊后的五年生存率约为10%，是预后最差的恶性肿瘤之一。胰腺癌临床症状隐匿且不典型，是诊断和治疗都很困难的消化道恶性肿瘤。
体外培养的胃类器官含有多种细胞克隆亚群，常衍生于胃干细胞或者多能诱导干细胞，其培养环境模拟体内的微环境，因此胃类器官在细胞组分、空间结构和生物功能等方面与胃上皮组织高度类似，为人类胃的生理与疾病的研究提供了一个有利的平台和工具。
人肺类器官(human lung organoid, hLOs)拥有类似支气管和肺泡的结构，与人肺部组织结构功能相似，培养过程复杂。研究人员利用小分子化合物和细胞因子诱导干细胞生成了内胚层，再让内胚层形成三维组织，得到了类似胚胎中早期肺的组织，进一步使其发育成为肺部组织。
肾脏是人体中重要器官之一，具有清除代谢废物，维持电解质平衡等生理功能，保证机体内环境的稳定。肾脏类器官(kidney organoid)是肾脏功能的3D模型，有利于人类肾脏疾病的建模，大多由多能人类干细胞(PSC)在体外经诱导生成，能够表达出和人肾单位相似的各类结构，如肾小球足细胞、近端小管、远端小管、集合管等。
肝脏是人体中最大的器官之一，来源于内胚层中前肠上皮细胞发育而来的肝芽结构，以代谢功能为主，发挥“解毒”作用。肝功能失衡会导致称为肝衰竭的病理状况，并导致肝炎、纤维化、肝硬化、癌症、代谢或自身免疫性疾病。
心脏是哺乳动物最先形成的器官之一，这使得它极易受到内在和外在疾病因素的影响。
类器官是一种在体外3D培养并模拟体内器官的细胞结构，可以更准确地保留体内细胞的生物学特性和功能。乳腺类器官可以准确再现体内乳房微环境，并已被用于检查影响信号转导、基因表达和组织重塑的因素。
